The polygenic implication of clopidogrel responsiveness: Insights from platelet reactivity analysis and next-generation sequencing

Omar Echeverría; Mariana Angulo-Aguado; Ricardo Vela; Carlos Calderón-Ospina; Katherine Parra; Nora Contreras; Adrien Morel; Rodrigo Cabrera; Carlos Restrepo; Carolina Ramírez-Santana; Oscar Ortega-Recalde; Manuel Eduardo Rojas-Quintana; Luisa Murcia-Soriano; Cristian Camilo Gaviria-Sabogal; Nattaly Valero; Dora Janeth Fonseca-Mendoza

doi:10.1371/journal.pone.0306445

The polygenic implication of clopidogrel responsiveness: Insights from platelet reactivity analysis and next-generation sequencing

Título traducido de la contribución: Implicación poligénica de la respuesta al clopidogrel: perspectivas a partir del análisis de la reactividad plaquetaria y la secuenciación de próxima generación

Omar Echeverría, Mariana Angulo-Aguado, Ricardo Vela, Carlos Calderón-Ospina, Katherine Parra, Nora Contreras, Adrien Morel, Rodrigo Cabrera, Carlos Restrepo, Carolina Ramírez-Santana, Oscar Ortega-Recalde, Manuel Eduardo Rojas-Quintana, Luisa Murcia-Soriano, Cristian Camilo Gaviria-Sabogal, Nattaly Valero, Dora Janeth Fonseca-Mendoza

Producción científica: Contribución a una revista › Artículo › revisión exhaustiva

Resumen

El clopidogrel se utiliza ampliamente en todo el mundo como terapia antiplaquetaria en pacientes con enfermedad coronaria aguda. Los factores genéticos influyen en la variabilidad interindividual en la respuesta. Algunos estudios han explorado las contribuciones poligénicas en la respuesta al fármaco, generando puntajes de riesgo farmacogenómico (PgxPRS). Es importante destacar que estos factores son menos explorados en poblaciones subrepresentadas, como los países latinoamericanos. Identificar pacientes con riesgo de reactividad plaquetaria alta durante el tratamiento (HTPR) es muy valioso en la medicina traslacional. En este estudio, utilizamos un panel personalizado de secuenciación de próxima generación (NGS) compuesto por 91 polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) y 28 genes relacionados con el metabolismo del clopidogrel, para analizar 70 pacientes con valores de reactividad plaquetaria, evaluados a través del tiempo de cierre (CT). Nuestros resultados demostraron la asociación de los SNP con HTPR y no HTPR, revelando las asociaciones más fuertes con rs2286823 (OR: 5,0; IC del 95%: 1,02–24,48; p: 0,03), rs2032582 (OR: 4,41; IC del 95%: 1,20–16,12; p: 0,019) y rs1045642 (OR: 3,38; IC del 95%: 0,96–11,9; p: 0,05). El análisis de regresión bivariada demostró la asociación significativa de varios SNP con el valor de CT, un biomarcador "sustituto" de la respuesta al clopidogrel. Los resultados exploratorios del modelo de regresión LASSO mostraron una alta capacidad discriminatoria entre pacientes HTPR y no HTPR (AUC: 0,955), y la PgxPRS generada demostró una asociación negativa significativa entre la puntuación de riesgo, el valor de CT y la condición de HTPR y no HTPR. Hasta donde sabemos, nuestro estudio aborda por primera vez el análisis de la contribución poligénica en la reactividad plaquetaria utilizando NGS y establece la PgxPRS derivada del modelo LASSO. Nuestros resultados demuestran la implicación poligénica de la respuesta al clopidogrel y ofrecen información aplicable a la medicina traslacional de la terapia antiplaquetaria en una población poco estudiada.

Título traducido de la contribución	Implicación poligénica de la respuesta al clopidogrel: perspectivas a partir del análisis de la reactividad plaquetaria y la secuenciación de próxima generación
Idioma original	Inglés
Número de artículo	e0306445
Páginas (desde-hasta)	e0306445
Publicación	PLoS ONE
Volumen	19
N.º	7 JULY
DOI	https://doi.org/10.1371/journal.pone.0306445
Estado	Publicada - 11 jul. 2024

ODS de las Naciones Unidas

Este resultado contribuye a los siguientes Objetivos de Desarrollo Sostenible

Acceder al documento

10.1371/journal.pone.0306445

Huella

Profundice en los temas de investigación de 'Implicación poligénica de la respuesta al clopidogrel: perspectivas a partir del análisis de la reactividad plaquetaria y la secuenciación de próxima generación: Insights from platelet reactivity analysis and next-generation sequencing'. En conjunto forman una huella única.

Implicación del riesgo poligénico en la reactividad plaquetaria de pacientes con síndrome coronario agudo tratados con clopidogrel
Murcia Soriano, L. F. (Investigador principal), Fonseca-Mendoza, D. J. (Investigador principal), Restrepo, C. M. (Coinvestigador), Contreras, N. (Coinvestigador), Morel, A. (Coinvestigador), Cabrera, R. (Coinvestigador), Parra Abaunza, K. (Coinvestigador), Ortega-Recalde, O. (Coinvestigador), Angulo-Aguado, M. (Coinvestigador) & Calderón-Ospina, C. A. (Coinvestigador)
10/12/21 → 20/09/24
Proyecto: Investigación › Investigación Traslacional

Citar esto

Echeverría, O., Angulo-Aguado, M., Vela, R., Calderón-Ospina, C., Parra, K., Contreras, N., Morel, A., Cabrera, R., Restrepo, C., Ramírez-Santana, C., Ortega-Recalde, O., Rojas-Quintana, M. E., Murcia-Soriano, L., Gaviria-Sabogal, C. C., Valero, N., & Fonseca-Mendoza, D. J. (2024). The polygenic implication of clopidogrel responsiveness: Insights from platelet reactivity analysis and next-generation sequencing. PLoS ONE, 19(7 JULY), e0306445. Artículo e0306445. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0306445

@article{6a8f171bcf38413195945aae8be87b96,

title = "The polygenic implication of clopidogrel responsiveness: Insights from platelet reactivity analysis and next-generation sequencing",

abstract = "El clopidogrel se utiliza ampliamente en todo el mundo como terapia antiplaquetaria en pacientes con enfermedad coronaria aguda. Los factores gen{\'e}ticos influyen en la variabilidad interindividual en la respuesta. Algunos estudios han explorado las contribuciones polig{\'e}nicas en la respuesta al f{\'a}rmaco, generando puntajes de riesgo farmacogen{\'o}mico (PgxPRS). Es importante destacar que estos factores son menos explorados en poblaciones subrepresentadas, como los pa{\'i}ses latinoamericanos. Identificar pacientes con riesgo de reactividad plaquetaria alta durante el tratamiento (HTPR) es muy valioso en la medicina traslacional. En este estudio, utilizamos un panel personalizado de secuenciaci{\'o}n de pr{\'o}xima generaci{\'o}n (NGS) compuesto por 91 polimorfismos de un solo nucle{\'o}tido (SNP) y 28 genes relacionados con el metabolismo del clopidogrel, para analizar 70 pacientes con valores de reactividad plaquetaria, evaluados a trav{\'e}s del tiempo de cierre (CT). Nuestros resultados demostraron la asociaci{\'o}n de los SNP con HTPR y no HTPR, revelando las asociaciones m{\'a}s fuertes con rs2286823 (OR: 5,0; IC del 95%: 1,02–24,48; p: 0,03), rs2032582 (OR: 4,41; IC del 95%: 1,20–16,12; p: 0,019) y rs1045642 (OR: 3,38; IC del 95%: 0,96–11,9; p: 0,05). El an{\'a}lisis de regresi{\'o}n bivariada demostr{\'o} la asociaci{\'o}n significativa de varios SNP con el valor de CT, un biomarcador {"}sustituto{"} de la respuesta al clopidogrel. Los resultados exploratorios del modelo de regresi{\'o}n LASSO mostraron una alta capacidad discriminatoria entre pacientes HTPR y no HTPR (AUC: 0,955), y la PgxPRS generada demostr{\'o} una asociaci{\'o}n negativa significativa entre la puntuaci{\'o}n de riesgo, el valor de CT y la condici{\'o}n de HTPR y no HTPR. Hasta donde sabemos, nuestro estudio aborda por primera vez el an{\'a}lisis de la contribuci{\'o}n polig{\'e}nica en la reactividad plaquetaria utilizando NGS y establece la PgxPRS derivada del modelo LASSO. Nuestros resultados demuestran la implicaci{\'o}n polig{\'e}nica de la respuesta al clopidogrel y ofrecen informaci{\'o}n aplicable a la medicina traslacional de la terapia antiplaquetaria en una poblaci{\'o}n poco estudiada.",

keywords = "Humans, Clopidogrel/therapeutic use, Polymorphism, Single Nucleotide, Male, High-Throughput Nucleotide Sequencing/methods, Female, Platelet Aggregation Inhibitors/therapeutic use, Middle Aged, Blood Platelets/drug effects, Aged, Multifactorial Inheritance/genetics, Ticlopidine/analogs & derivatives",

author = "Omar Echeverr{\'i}a and Mariana Angulo-Aguado and Ricardo Vela and Carlos Calder{\'o}n-Ospina and Katherine Parra and Nora Contreras and Adrien Morel and Rodrigo Cabrera and Carlos Restrepo and Carolina Ram{\'i}rez-Santana and Oscar Ortega-Recalde and Rojas-Quintana, {Manuel Eduardo} and Luisa Murcia-Soriano and Gaviria-Sabogal, {Cristian Camilo} and Nattaly Valero and Fonseca-Mendoza, {Dora Janeth}",

note = "Copyright: {\textcopyright} 2024 Echeverr{\'i}a et al. This is an open access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License, which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original author and source are credited.",

year = "2024",

month = jul,

day = "11",

doi = "10.1371/journal.pone.0306445",

language = "Ingl{\'e}s",

volume = "19",

pages = "e0306445",

journal = "PLoS ONE",

issn = "1932-6203",

publisher = "Public Library of Science",

number = "7 JULY",

}

Echeverría, O, Angulo-Aguado, M, Vela, R, Calderón-Ospina, C, Parra, K, Contreras, N, Morel, A, Cabrera, R, Restrepo, C, Ramírez-Santana, C, Ortega-Recalde, O, Rojas-Quintana, ME, Murcia-Soriano, L, Gaviria-Sabogal, CC, Valero, N & Fonseca-Mendoza, DJ 2024, 'The polygenic implication of clopidogrel responsiveness: Insights from platelet reactivity analysis and next-generation sequencing', PLoS ONE, vol. 19, n.º 7 JULY, e0306445, pp. e0306445. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0306445

TY - JOUR

T1 - The polygenic implication of clopidogrel responsiveness

T2 - Insights from platelet reactivity analysis and next-generation sequencing

AU - Echeverría, Omar

AU - Angulo-Aguado, Mariana

AU - Vela, Ricardo

AU - Calderón-Ospina, Carlos

AU - Parra, Katherine

AU - Contreras, Nora

AU - Morel, Adrien

AU - Cabrera, Rodrigo

AU - Restrepo, Carlos

AU - Ramírez-Santana, Carolina

AU - Ortega-Recalde, Oscar

AU - Rojas-Quintana, Manuel Eduardo

AU - Murcia-Soriano, Luisa

AU - Gaviria-Sabogal, Cristian Camilo

AU - Valero, Nattaly

AU - Fonseca-Mendoza, Dora Janeth

N1 - Copyright: © 2024 Echeverría et al. This is an open access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution License, which permits unrestricted use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original author and source are credited.

PY - 2024/7/11

Y1 - 2024/7/11

N2 - El clopidogrel se utiliza ampliamente en todo el mundo como terapia antiplaquetaria en pacientes con enfermedad coronaria aguda. Los factores genéticos influyen en la variabilidad interindividual en la respuesta. Algunos estudios han explorado las contribuciones poligénicas en la respuesta al fármaco, generando puntajes de riesgo farmacogenómico (PgxPRS). Es importante destacar que estos factores son menos explorados en poblaciones subrepresentadas, como los países latinoamericanos. Identificar pacientes con riesgo de reactividad plaquetaria alta durante el tratamiento (HTPR) es muy valioso en la medicina traslacional. En este estudio, utilizamos un panel personalizado de secuenciación de próxima generación (NGS) compuesto por 91 polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) y 28 genes relacionados con el metabolismo del clopidogrel, para analizar 70 pacientes con valores de reactividad plaquetaria, evaluados a través del tiempo de cierre (CT). Nuestros resultados demostraron la asociación de los SNP con HTPR y no HTPR, revelando las asociaciones más fuertes con rs2286823 (OR: 5,0; IC del 95%: 1,02–24,48; p: 0,03), rs2032582 (OR: 4,41; IC del 95%: 1,20–16,12; p: 0,019) y rs1045642 (OR: 3,38; IC del 95%: 0,96–11,9; p: 0,05). El análisis de regresión bivariada demostró la asociación significativa de varios SNP con el valor de CT, un biomarcador "sustituto" de la respuesta al clopidogrel. Los resultados exploratorios del modelo de regresión LASSO mostraron una alta capacidad discriminatoria entre pacientes HTPR y no HTPR (AUC: 0,955), y la PgxPRS generada demostró una asociación negativa significativa entre la puntuación de riesgo, el valor de CT y la condición de HTPR y no HTPR. Hasta donde sabemos, nuestro estudio aborda por primera vez el análisis de la contribución poligénica en la reactividad plaquetaria utilizando NGS y establece la PgxPRS derivada del modelo LASSO. Nuestros resultados demuestran la implicación poligénica de la respuesta al clopidogrel y ofrecen información aplicable a la medicina traslacional de la terapia antiplaquetaria en una población poco estudiada.

AB - El clopidogrel se utiliza ampliamente en todo el mundo como terapia antiplaquetaria en pacientes con enfermedad coronaria aguda. Los factores genéticos influyen en la variabilidad interindividual en la respuesta. Algunos estudios han explorado las contribuciones poligénicas en la respuesta al fármaco, generando puntajes de riesgo farmacogenómico (PgxPRS). Es importante destacar que estos factores son menos explorados en poblaciones subrepresentadas, como los países latinoamericanos. Identificar pacientes con riesgo de reactividad plaquetaria alta durante el tratamiento (HTPR) es muy valioso en la medicina traslacional. En este estudio, utilizamos un panel personalizado de secuenciación de próxima generación (NGS) compuesto por 91 polimorfismos de un solo nucleótido (SNP) y 28 genes relacionados con el metabolismo del clopidogrel, para analizar 70 pacientes con valores de reactividad plaquetaria, evaluados a través del tiempo de cierre (CT). Nuestros resultados demostraron la asociación de los SNP con HTPR y no HTPR, revelando las asociaciones más fuertes con rs2286823 (OR: 5,0; IC del 95%: 1,02–24,48; p: 0,03), rs2032582 (OR: 4,41; IC del 95%: 1,20–16,12; p: 0,019) y rs1045642 (OR: 3,38; IC del 95%: 0,96–11,9; p: 0,05). El análisis de regresión bivariada demostró la asociación significativa de varios SNP con el valor de CT, un biomarcador "sustituto" de la respuesta al clopidogrel. Los resultados exploratorios del modelo de regresión LASSO mostraron una alta capacidad discriminatoria entre pacientes HTPR y no HTPR (AUC: 0,955), y la PgxPRS generada demostró una asociación negativa significativa entre la puntuación de riesgo, el valor de CT y la condición de HTPR y no HTPR. Hasta donde sabemos, nuestro estudio aborda por primera vez el análisis de la contribución poligénica en la reactividad plaquetaria utilizando NGS y establece la PgxPRS derivada del modelo LASSO. Nuestros resultados demuestran la implicación poligénica de la respuesta al clopidogrel y ofrecen información aplicable a la medicina traslacional de la terapia antiplaquetaria en una población poco estudiada.

KW - Humans

KW - Clopidogrel/therapeutic use

KW - Polymorphism, Single Nucleotide

KW - Male

KW - High-Throughput Nucleotide Sequencing/methods

KW - Female

KW - Platelet Aggregation Inhibitors/therapeutic use

KW - Middle Aged

KW - Blood Platelets/drug effects

KW - Aged

KW - Multifactorial Inheritance/genetics

KW - Ticlopidine/analogs & derivatives

UR - http://www.scopus.com/inward/record.url?scp=85198340062&partnerID=8YFLogxK

UR - https://www.mendeley.com/catalogue/a476ddc1-4584-37e2-b3aa-ae3928c014bf/

U2 - 10.1371/journal.pone.0306445

DO - 10.1371/journal.pone.0306445

M3 - Artículo

C2 - 38991024

SN - 1932-6203

VL - 19

SP - e0306445

JO - PLoS ONE

JF - PLoS ONE

IS - 7 JULY

M1 - e0306445

ER -

The polygenic implication of clopidogrel responsiveness: Insights from platelet reactivity analysis and next-generation sequencing

Resumen

ODS de las Naciones Unidas

Acceder al documento

Huella

Proyectos

Implicación del riesgo poligénico en la reactividad plaquetaria de pacientes con síndrome coronario agudo tratados con clopidogrel

Citar esto